朱希孝很快结了案，案词是和葛守礼与冯保达成一致的：王吉是社会无赖，侥幸进了大内被捉，胡说八道诬陷高拱指使，想脱罪，交刑部拟罪。
朱翊钧很不满意这结果，他对张居正说：“哪里有这样简单的事？王吉进入大内是偶然事件？背后没有指使人？这不可能啊。”
李太后默不作声，张居正也就不说话，并拿眼去看冯保。冯保得了指示，说道：“皇上，这件事真就这么简单。三堂会审结果也得到了官员们的认可。”
朱翊钧在椅子上来回蹭着。李太后轻轻咳嗽一声，他老实了。李太后轻启朱唇：“张先生，你怎么看？”
张居正略一思索，回道：“三堂会审是权威，没有问题。王吉案可以结案。”
朱翊钧很不忿，但不敢发作。李太后微微点了点头，说：“那就照三堂会审的结果判吧。”
王吉被判斩首，即刻行刑。正史说，王吉是冤枉的，流的血非常无辜。这种论调实在让人奇怪，他私闯大内，就是死罪，被斩首何来冤枉？
当然这是个疑案，王吉是怎么进的大内，为什么要进大内，恐怕只有掉了脑袋的王吉本人知道。朱希孝用十天时间调查来龙去脉，也没查出任何结果。他能迅速做出判决，大概也是受了张居正“不要牵连任何人”的暗示吧。